More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2060 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  54.64 
 
 		 601 aa  671    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  78.2 
 
 		 602 aa  1002    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  56.4 
 
 		 601 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  55.05 
 
 		 601 aa  693    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  54.88 
 
 		 601 aa  690    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  79.87 
 
 		 602 aa  1021    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  56.35 
 
 		 602 aa  703    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  56.4 
 
 		 601 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  56.46 
 
 		 588 aa  692    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  68.31 
 
 		 611 aa  901    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  53.03 
 
 		 599 aa  650    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 601 aa  1260    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  53.12 
 
 		 601 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  52.26 
 
 		 598 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  50.33 
 
 		 598 aa  611  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  49.83 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  50.17 
 
 		 598 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 		 597 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  50.34 
 
 		 597 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 		 597 aa  595  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 		 597 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  49.25 
 
 		 601 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  49.25 
 
 		 601 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  49.24 
 
 		 601 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 		 598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  49.41 
 
 		 601 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  51.41 
 
 		 568 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  49.66 
 
 		 597 aa  581  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  49.65 
 
 		 597 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  41.02 
 
 		 633 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 		 603 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 603 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  38.71 
 
 		 587 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 603 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 633 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 592 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 610 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 610 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.28 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  37.31 
 
 		 592 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.2 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 609 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 598 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 610 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 617 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 592 aa  360  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 622 aa  359  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 612 aa  355  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 612 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.45 
 
 		 610 aa  350  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 596 aa  346  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 606 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 606 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 606 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 607 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 590 aa  336  7.999999999999999e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 597 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 630 aa  334  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 616 aa  329  9e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 602 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 649 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 613 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 605 aa  319  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 603 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 626 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 602 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 663 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 649 aa  313  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 		 603 aa  313  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 604 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 622 aa  312  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 595 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 599 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 604 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 604 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 601 aa  310  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 618 aa  310  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 647 aa  309  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 605 aa  308  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 599 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 594 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 602 aa  306  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 609 aa  306  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>