52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2019 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  92.54 
 
 		 228 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  86.28 
 
 		 226 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  91.28 
 
 		 195 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  68 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  66.81 
 
 		 226 aa  325  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  67.11 
 
 		 226 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  66.22 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  66.67 
 
 		 226 aa  317  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  315  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  64.6 
 
 		 226 aa  314  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  65.33 
 
 		 226 aa  314  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  65.33 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  65.33 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  65.33 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  64.44 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  64.6 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  61.16 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  60.44 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  59.29 
 
 		 226 aa  291  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  52.44 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  50.67 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  47.71 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  48.43 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  47.98 
 
 		 223 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  47.32 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  45.95 
 
 		 226 aa  211  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  45.25 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  46.08 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  42.86 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  43.5 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  38.39 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  26.7 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  27.16 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  27.48 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  25.84 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  24.17 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  26.74 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  23.92 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  23.15 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  26.58 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  26.58 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  22.6 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  25.95 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  29.33 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>