264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2012 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  100 
 
 
208 aa  431  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  74.88 
 
 
216 aa  329  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  75 
 
 
216 aa  327  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  61.46 
 
 
215 aa  269  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.5 
 
 
210 aa  248  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  54.33 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  54.33 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  54.33 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  53.59 
 
 
210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  53.59 
 
 
210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  53.59 
 
 
210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  53.59 
 
 
210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  56.85 
 
 
204 aa  242  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  53.85 
 
 
210 aa  241  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  53.59 
 
 
210 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  57.44 
 
 
202 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
211 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.33 
 
 
211 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.81 
 
 
210 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  58.76 
 
 
204 aa  235  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  56.63 
 
 
200 aa  234  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  53.03 
 
 
203 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.02 
 
 
210 aa  227  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.02 
 
 
210 aa  227  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.02 
 
 
210 aa  227  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.12 
 
 
206 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.26 
 
 
206 aa  224  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.52 
 
 
203 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.01 
 
 
203 aa  216  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.81 
 
 
210 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.52 
 
 
203 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.22 
 
 
208 aa  214  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  51.01 
 
 
200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 
200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  51.52 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  48 
 
 
206 aa  205  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 
188 aa  204  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.53 
 
 
207 aa  203  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  50.25 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  49.05 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  49.05 
 
 
209 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  49.05 
 
 
205 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 
205 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 
206 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  52.58 
 
 
205 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  52.58 
 
 
205 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  47.12 
 
 
215 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.48 
 
 
205 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.23 
 
 
201 aa  191  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  45.67 
 
 
205 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  41.5 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  49.17 
 
 
194 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  44.92 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  43.35 
 
 
214 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  43.88 
 
 
200 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 
213 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  38.34 
 
 
204 aa  148  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  39.15 
 
 
378 aa  148  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  40 
 
 
361 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  40 
 
 
361 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40.72 
 
 
210 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
362 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40.53 
 
 
202 aa  141  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.46 
 
 
375 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 
368 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
201 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
196 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 
191 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
191 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.64 
 
 
194 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 
193 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 
197 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  31.75 
 
 
224 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
198 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 
196 aa  91.7  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  36.24 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  32.63 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  34.64 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  31.25 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  35.57 
 
 
191 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>