205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1912 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  63.49 
 
 		 483 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  62.32 
 
 		 483 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  1009    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  47.49 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.93 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  47.49 
 
 		 495 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  47.6 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  46.75 
 
 		 524 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  45.92 
 
 		 528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  45.31 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  45.31 
 
 		 529 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  45.1 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  43.58 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  45.34 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  43.12 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  43.12 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  42.8 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  44.54 
 
 		 486 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  42.8 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  41.22 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.53 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  39.34 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  39.34 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  40.53 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  40.56 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  39.92 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  40.37 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  39.84 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  41.58 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  39.18 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.62 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.24 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.57 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.19 
 
 		 316 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.04 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.74 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.24 
 
 		 255 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.21 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  24.27 
 
 		 285 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  27 
 
 		 287 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.79 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  24.38 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  24.38 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.11 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  20.3 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.14 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.32 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.64 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.4 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.35 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  22.3 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.08 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.65 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.52 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.37 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.91 
 
 		 281 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.11 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.56 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  26.57 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  28.11 
 
 		 265 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.66 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.91 
 
 		 281 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  23.31 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  23.31 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  21.88 
 
 		 290 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  23.31 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  23.31 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.62 
 
 		 296 aa  54.3  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.19 
 
 		 301 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.31 
 
 		 281 aa  54.3  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.99 
 
 		 307 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  22.93 
 
 		 300 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.16 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  23.11 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  26.18 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  21.51 
 
 		 285 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.82 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.89 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  25.12 
 
 		 289 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  25.68 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.11 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.12 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  23.11 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  24.19 
 
 		 329 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25.55 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.1 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  23.42 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.7 
 
 		 269 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  22.44 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 		 301 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  21.05 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  24.07 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  24.07 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2691  RimK domain protein ATP-grasp  28.16 
 
 		 263 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  24.07 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.07 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>