More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1911 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  100 
 
 
363 aa  755    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  57.89 
 
 
369 aa  454  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  55.92 
 
 
364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  41.76 
 
 
389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  41.71 
 
 
365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  43.96 
 
 
364 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  41.71 
 
 
365 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  41.99 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  39.62 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
381 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  38.4 
 
 
381 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  39.83 
 
 
382 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.09 
 
 
371 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
368 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  41.05 
 
 
373 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  36.86 
 
 
396 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  36.39 
 
 
429 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  39.13 
 
 
194 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  44.06 
 
 
158 aa  113  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
188 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
154 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
154 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
142 aa  94.4  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.14 
 
 
153 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
162 aa  90.1  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
146 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
164 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  41.58 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
168 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.69 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.64 
 
 
159 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.17 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
156 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
159 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
170 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  38.97 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  35.42 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.08 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.21 
 
 
153 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.54 
 
 
179 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  31.58 
 
 
141 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
149 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.39 
 
 
176 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.72 
 
 
152 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  29.93 
 
 
150 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
142 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.31 
 
 
168 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  30.61 
 
 
141 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  29.91 
 
 
141 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.39 
 
 
159 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.48 
 
 
181 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.86 
 
 
153 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
153 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.45 
 
 
176 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  30.61 
 
 
145 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.08 
 
 
139 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.77 
 
 
173 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.63 
 
 
144 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
153 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
169 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  27.78 
 
 
160 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.65 
 
 
162 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.15 
 
 
147 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  29.47 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  29.47 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  29 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  29.47 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  29.47 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.67 
 
 
159 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  29.47 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.38 
 
 
150 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.3 
 
 
166 aa  56.2  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.87 
 
 
185 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2998  acetyltransferase  36.05 
 
 
235 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.27 
 
 
176 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.46 
 
 
160 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  30.61 
 
 
145 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  30.21 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.76 
 
 
157 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  33.81 
 
 
156 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  29 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  30.21 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  30.21 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
158 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.96 
 
 
148 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.41 
 
 
147 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
158 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.35 
 
 
150 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
158 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>