261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1895 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  100 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  49.49 
 
 
199 aa  184  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  48.68 
 
 
199 aa  177  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  47.62 
 
 
196 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  47.37 
 
 
196 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  44.97 
 
 
196 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  45.79 
 
 
198 aa  151  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  46.03 
 
 
196 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  46.03 
 
 
196 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  46.03 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  44.39 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  44.39 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  44.39 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  44.39 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  43.85 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  44.39 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  44.39 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  44.39 
 
 
196 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  46.56 
 
 
196 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  44.39 
 
 
196 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  40.74 
 
 
196 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  41.71 
 
 
197 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  43.68 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0535  DJ-1 family protein  43.85 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865123  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0472  DJ-1 family protein  43.85 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  41.18 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0474  DJ-1 family protein  43.32 
 
 
196 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0480  DJ-1 family protein  43.32 
 
 
196 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.757447  normal  0.338171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0493  DJ-1 family protein  42.78 
 
 
196 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  40.24 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  31.69 
 
 
181 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  35.18 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  35.18 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  35.91 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
388 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  37.43 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  33.72 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  37.06 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  38.01 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  35.83 
 
 
190 aa  108  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  32.11 
 
 
189 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  36.26 
 
 
184 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  35.26 
 
 
183 aa  104  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  35.29 
 
 
185 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  37.64 
 
 
182 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  31.58 
 
 
189 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  37.17 
 
 
192 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  33.33 
 
 
182 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  30.81 
 
 
183 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  35.68 
 
 
184 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  31.05 
 
 
189 aa  101  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.93 
 
 
184 aa  101  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  37.17 
 
 
183 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  33.15 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  31.87 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  31.82 
 
 
181 aa  98.6  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  37.43 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  29.51 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  41.52 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.25 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  36.56 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.65 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  27.17 
 
 
191 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  27.72 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  27.17 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  32.97 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  30.27 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  31.98 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  26.74 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  26.74 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  28.34 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  29.38 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  25.58 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  33.16 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  29.03 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.34 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  24.59 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  25.86 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.34 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  26.16 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  28.11 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.11 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.57 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  27.47 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  28.57 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.47 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  28.02 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  30 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  27.37 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  26.67 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  29.86 
 
 
171 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  29.07 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  27.75 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.28 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  27.89 
 
 
171 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  27.17 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  24.34 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  27.75 
 
 
187 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  27.03 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>