168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1892 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  57.29 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  55.26 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  42.08 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  44.44 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.4 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.39 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.85 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  44.72 
 
 		 183 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.1 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.1 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.48 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.98 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  36.47 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.76 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.86 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  34.44 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.58 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  35.56 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  32.28 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.69 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.23 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.73 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  34.71 
 
 		 229 aa  98.2  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  30.53 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  30.53 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  29.9 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  30.37 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  33.16 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  31.05 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  31.05 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  29.1 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.95 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.37 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.23 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  32.91 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  29.95 
 
 		 232 aa  88.2  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  31.64 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  32.6 
 
 		 223 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  39.82 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  35.43 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  36.53 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  31.41 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  37.17 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  29.29 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  33.33 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  45.19 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.46 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.55 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  31.01 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  30.58 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  38.39 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.25 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  31.49 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  29 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  34.78 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  31.06 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  28.14 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.61 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.5 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  28.14 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.5 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.14 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.79 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.14 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.38 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  28.79 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  29.21 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  30 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.2 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  28.65 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  31.64 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  29.21 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.21 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.38 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  33.58 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  33.58 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  30.56 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  38.04 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  30.23 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  27.89 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  31.82 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  26.7 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>