More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1878 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  100 
 
 		 367 aa  757    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  79.54 
 
 		 379 aa  584  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  79.34 
 
 		 334 aa  569  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  70.44 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  64.29 
 
 		 359 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  66.25 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  64.29 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  61.03 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  53.27 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  52.08 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  51.13 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  50.85 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  50.85 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  51.59 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  51.59 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  51.59 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  52.99 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  51.59 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  52.73 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  56.12 
 
 		 350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  57.01 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  50 
 
 		 347 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  53.05 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  49.7 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  52.02 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  53.77 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  52.05 
 
 		 344 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  51.75 
 
 		 349 aa  342  8e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  48.28 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  49.84 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  48.91 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  47.27 
 
 		 349 aa  309  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  49.22 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  45.23 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  43.57 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  45.54 
 
 		 348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  45.89 
 
 		 343 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  45.35 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  44.15 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  44.15 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  44.15 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  43.64 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  43.86 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  43.86 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  43.07 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  43.07 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  43.07 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  43.07 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  42.77 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  43.07 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  42.77 
 
 		 351 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  42.77 
 
 		 351 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  42.48 
 
 		 351 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  42.68 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  42.68 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  39.94 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  40.69 
 
 		 349 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  38.56 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  40 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  38.87 
 
 		 338 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  43.12 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  37.7 
 
 		 332 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  37.38 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  40.92 
 
 		 343 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  39.06 
 
 		 361 aa  235  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  41.43 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  36.59 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  41.79 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  39.09 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  36.06 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  37.86 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  38.28 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  39.81 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0092  ApbE family lipoprotein  36.61 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  37.18 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2105  thiamine biosynthesis lipoprotein, putative  34.88 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  37.62 
 
 		 321 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  35.71 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1900  ApbE-like lipoprotein  33.65 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  0.0133899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.76 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.48 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  36.45 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  37.83 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  34.19 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  33.14 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  35.76 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  37.41 
 
 		 341 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  37.14 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  36.48 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  35.76 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  36.51 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  35.06 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  32.31 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  34.94 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  35.29 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  36.15 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  36.54 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  34.52 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  35.52 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  33.65 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>