More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1868 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  88.32 
 
 		 429 aa  754    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  83.02 
 
 		 430 aa  711    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  88.32 
 
 		 429 aa  760    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  840    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.79 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.56 
 
 		 429 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.96 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.56 
 
 		 429 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.09 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.32 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  68.76 
 
 		 429 aa  594  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  68.3 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.07 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.38 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.38 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.15 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.15 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.38 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  68.15 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.68 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.9 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.98 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.88 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.12 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  65.88 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.88 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.18 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  65.65 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.12 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.06 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.26 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.71 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  64.24 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.19 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.11 
 
 		 432 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.03 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  59.95 
 
 		 449 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.41 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60 
 
 		 434 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  59.72 
 
 		 449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60 
 
 		 434 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.39 
 
 		 449 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.15 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.25 
 
 		 449 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.39 
 
 		 449 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  60.56 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.22 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  60.8 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.35 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  58.59 
 
 		 433 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  61.18 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.88 
 
 		 433 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  58.12 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.51 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  57.65 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.41 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.59 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.15 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.18 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.94 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.18 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.18 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  57.18 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.54 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.47 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.51 
 
 		 446 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  57.85 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.81 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  56.71 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  56.71 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  56.71 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  55.06 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  57.75 
 
 		 430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  55.29 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.34 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.06 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.27 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  53.63 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  53.63 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  53.63 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.99 
 
 		 460 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.8 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  53.63 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.33 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.82 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.33 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.57 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.37 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.34 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.1 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.69 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3208  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.54 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.71 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  52.69 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  52.69 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.76 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  51.76 
 
 		 470 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.52 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.76 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.69 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>