More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1823 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3614  acyl-CoA dehydrogenase  48.77 
 
 		 815 aa  728    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0152868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00216  acyl-CoA dehydrogenase  69.11 
 
 		 814 aa  1142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3386  Protein of unknown function DUF1974  69.11 
 
 		 814 aa  1143    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1893  acyl-CoA dehydrogenase  52.37 
 
 		 815 aa  796    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0265  acyl-CoA dehydrogenase  68.98 
 
 		 814 aa  1139    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.717357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0949  acyl-CoA dehydrogenase  67.04 
 
 		 818 aa  1124    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0537  acyl-CoA dehydrogenase  54.18 
 
 		 835 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0153828  normal  0.335632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2172  acyl-CoA dehydrogenase  51.54 
 
 		 759 aa  761    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.272343  normal  0.175191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2338  acyl-CoA dehydrogenase  52.55 
 
 		 760 aa  771    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.797755  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4530  acyl-CoA dehydrogenase  51.54 
 
 		 759 aa  761    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1823  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 814 aa  1667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2265  acyl-CoA dehydrogenase  63.81 
 
 		 809 aa  1090    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2542  acyl-CoA dehydrogenase  51.26 
 
 		 758 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.204346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2395  acyl-CoA dehydrogenase  73.48 
 
 		 815 aa  1199    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3064  acyl-CoA dehydrogenase  52.37 
 
 		 825 aa  811    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221782  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2492  acyl-CoA dehydrogenase  51.94 
 
 		 759 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2536  acyl-CoA dehydrogenase  67.21 
 
 		 815 aa  1119    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3857  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.27 
 
 		 815 aa  823    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.870588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03204  acyl-CoA dehydrogenase  84.08 
 
 		 814 aa  1411    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3822  acyl-CoA dehydrogenase  51.51 
 
 		 815 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15490  acyl-CoA dehydrogenase  52.62 
 
 		 815 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01663  acyl-CoA dehydrogenase  54.94 
 
 		 803 aa  835    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0967153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1917  acyl-CoA dehydrogenase  51.25 
 
 		 815 aa  791    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00575597  normal  0.572589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2257  acyl-CoA dehydrogenase  51.54 
 
 		 759 aa  759    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00094782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0923  acyl-CoA dehydrogenase  65.93 
 
 		 812 aa  1117    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1691  acyl-CoA dehydrogenase  54.03 
 
 		 828 aa  859    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0432  acyl-CoA dehydrogenase  50.79 
 
 		 836 aa  805    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1690  acyl-CoA dehydrogenase  54.4 
 
 		 828 aa  865    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1628  acyl-CoA dehydrogenase  52.53 
 
 		 815 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1700  acyl-CoA dehydrogenase  52.57 
 
 		 889 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1835  acyl-CoA dehydrogenase  42.84 
 
 		 994 aa  668    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1503  acyl-CoA dehydrogenase  52.64 
 
 		 815 aa  781    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.943527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1544  acyl-CoA dehydrogenase  53.82 
 
 		 784 aa  852    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0853542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1863  acyl-CoA dehydrogenase  51.94 
 
 		 759 aa  765    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2244  acyl-CoA dehydrogenase  51.54 
 
 		 759 aa  761    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0249  acyl-CoA dehydrogenase  69.11 
 
 		 814 aa  1144    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2108  acyl-CoA dehydrogenase  65.03 
 
 		 815 aa  1100    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000635776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2995  acyl-CoA dehydrogenase  50.07 
 
 		 755 aa  722    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0174  acyl-CoA dehydrogenase  50.74 
 
 		 756 aa  723    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02616  acyl-CoA dehydrogenase  47.11 
 
 		 749 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1735  acyl-CoA dehydrogenase  52.2 
 
 		 781 aa  803    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.445191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1999  acyl-CoA dehydrogenase  64.05 
 
 		 815 aa  1075    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0412808  decreased coverage  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0253  acyl-CoA dehydrogenase  69.11 
 
 		 814 aa  1144    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4184  acyl-CoA dehydrogenase  51.76 
 
 		 815 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3309  acyl-CoA dehydrogenase  67.16 
 
 		 815 aa  1141    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2393  acyl-CoA dehydrogenase  64.72 
 
 		 815 aa  1097    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2306  acyl-CoA dehydrogenase  66.83 
 
 		 815 aa  1115    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000182172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2051  acyl-CoA dehydrogenase  52 
 
 		 758 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.217248  normal  0.456304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0490  acyl-CoA dehydrogenase  44.33 
 
 		 949 aa  661    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0094  acyl-CoA dehydrogenase  55.95 
 
 		 779 aa  849    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2067  acyl-CoA dehydrogenase  66.71 
 
 		 815 aa  1112    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000576989  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0805  acyl-CoA dehydrogenase  54.05 
 
 		 829 aa  832    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2019  acyl-CoA dehydrogenase  66.83 
 
 		 815 aa  1113    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000019403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0358  acyl-CoA dehydrogenase  68.41 
 
 		 814 aa  1127    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.7933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0217  acyl-CoA dehydrogenase  68.98 
 
 		 814 aa  1140    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0417  acyl-CoA dehydrogenase  51.28 
 
 		 836 aa  813    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332729  hitchhiker  0.000590412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2774  acyl-CoA dehydrogenase  52.06 
 
 		 832 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0195981  normal  0.587506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2067  acyl-CoA dehydrogenase  51.28 
 
 		 758 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0937287  decreased coverage  0.0000695411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02152  acyl-CoA dehydrogenase  63.53 
 
 		 820 aa  1074    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2604  acyl-CoA dehydrogenase  64.79 
 
 		 815 aa  1090    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.114401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1234  acyl-CoA dehydrogenase  46.34 
 
 		 745 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1764  acyl-CoA dehydrogenase  65.34 
 
 		 815 aa  1100    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2115  acyl-CoA dehydrogenase  51.82 
 
 		 758 aa  776    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000818712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2342  acyl-CoA dehydrogenase  53.71 
 
 		 815 aa  810    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1510  acyl-CoA dehydrogenase  45.76 
 
 		 815 aa  687    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1085  acyl-CoA dehydrogenase  49.33 
 
 		 756 aa  715    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0233  acyl-CoA dehydrogenase  68.98 
 
 		 814 aa  1142    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2120  acyl-CoA dehydrogenase  43.03 
 
 		 979 aa  670    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3399  acyl-CoA dehydrogenase  69.11 
 
 		 814 aa  1143    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0758  acyl-CoA dehydrogenase  66.87 
 
 		 814 aa  1117    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1676  acyl-CoA dehydrogenase  52.33 
 
 		 832 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761188  normal  0.240314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1468  acyl-CoA dehydrogenase  52.24 
 
 		 815 aa  776    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.890646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3171  acyl-CoA dehydrogenase  67.16 
 
 		 815 aa  1140    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3810  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.34 
 
 		 833 aa  695    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.753342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2127  acyl-CoA dehydrogenase  51.54 
 
 		 759 aa  761    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00720758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1688  acyl-CoA dehydrogenase  47.19 
 
 		 751 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2492  acyl-CoA dehydrogenase  60.71 
 
 		 821 aa  1051    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000835865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3036  acyl-CoA dehydrogenase  51.19 
 
 		 757 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2319  acyl-CoA dehydrogenase  66.71 
 
 		 815 aa  1113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000853883  hitchhiker  0.00160495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2049  acyl-CoA dehydrogenase  52.21 
 
 		 759 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156017  normal  0.197509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2146  acyl-CoA dehydrogenase  67.21 
 
 		 815 aa  1119    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000466188  normal  0.548318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1926  acyl-CoA dehydrogenase  52.21 
 
 		 759 aa  770    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.442387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2223  acyl-CoA dehydrogenase  67.08 
 
 		 815 aa  1118    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00555832  normal  0.222627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2124  acyl-CoA dehydrogenase  51.28 
 
 		 824 aa  775    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441583 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2128  acyl-CoA dehydrogenase  50.07 
 
 		 774 aa  735    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0257482  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1869  acyl-CoA dehydrogenase  64.29 
 
 		 815 aa  1093    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.203796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1889  acyl-CoA dehydrogenase  52.51 
 
 		 758 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1340  acyl-CoA dehydrogenase  50.34 
 
 		 760 aa  746    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.920071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1791  acyl-CoA dehydrogenase  67.21 
 
 		 815 aa  1118    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000904865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27730  acyl-CoA dehydrogenase  53.65 
 
 		 815 aa  813    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0291961 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1870  acyl-CoA dehydrogenase  66.13 
 
 		 815 aa  1102    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1260  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 858 aa  762    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276244  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1815  acyl-CoA dehydrogenase  52.45 
 
 		 759 aa  787    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0595406  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1490  acyl-CoA dehydrogenase  46.43 
 
 		 715 aa  647    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02638  acyl-CoA dehydrogenase  49 
 
 		 761 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0687  acyl-CoA dehydrogenase  46.28 
 
 		 715 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3558  acyl-CoA dehydrogenase  47.96 
 
 		 778 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2154  acyl-CoA dehydrogenase  52.21 
 
 		 759 aa  770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136842  normal  0.840722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2323  acyl-CoA dehydrogenase  67.08 
 
 		 815 aa  1118    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.626171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3063  acyl-CoA dehydrogenase  45.87 
 
 		 819 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>