97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1795 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  55.51 
 
 
248 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  55.51 
 
 
248 aa  278  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  47.6 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.19 
 
 
235 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.48 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.31 
 
 
236 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.43 
 
 
235 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.96 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.3 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.3 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 
235 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.89 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.89 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.89 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.16 
 
 
216 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28 
 
 
235 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  28.38 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.44 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.95 
 
 
259 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.44 
 
 
235 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  29.11 
 
 
243 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.07 
 
 
235 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.51 
 
 
233 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.12 
 
 
255 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  30.77 
 
 
238 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.39 
 
 
244 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.07 
 
 
233 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.28 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  32.77 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  29.33 
 
 
235 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.88 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.91 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.8 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.74 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  28.07 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  27.31 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  28.25 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.47 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.27 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.17 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  30.99 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.76 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.36 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.36 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.91 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  27.32 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.31 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  28.14 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.94 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.94 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  28.92 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  25.23 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  25 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.58 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.28 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.28 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  25.81 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.11 
 
 
314 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.44 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  27.27 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  23.45 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  23.45 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  32.8 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  27.27 
 
 
240 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  25.17 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1552  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.33 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0153  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.33 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0673541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.26 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  24.86 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  21.92 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  19.69 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.97 
 
 
347 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4419  SAF domain-containing protein  26.21 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.35 
 
 
355 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  24.35 
 
 
239 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  22.09 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  27.5 
 
 
324 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  28.57 
 
 
236 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.07 
 
 
380 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.41 
 
 
416 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  25 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0570  SAF domain-containing protein  22.39 
 
 
281 aa  45.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3826  SAF domain-containing protein  24.19 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.294228 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1095  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.8 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3099  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.19 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  22.66 
 
 
502 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  22.66 
 
 
504 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.15 
 
 
140 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.17 
 
 
343 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.82 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  25.44 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3713  flageller protein FlgA  21.93 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  29.07 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1268  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  21.48 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.71 
 
 
360 aa  42  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>