More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1779 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  100 
 
 
377 aa  751  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  82.23 
 
 
377 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  82.23 
 
 
377 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  81.96 
 
 
377 aa  625  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  80.64 
 
 
377 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  80.64 
 
 
377 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  72.15 
 
 
376 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  71.88 
 
 
376 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  70.48 
 
 
402 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  72.15 
 
 
375 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  68.07 
 
 
378 aa  503  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  67.2 
 
 
377 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  70.03 
 
 
376 aa  500  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  66.58 
 
 
377 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  66.4 
 
 
379 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  63.97 
 
 
384 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  63.71 
 
 
384 aa  481  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  64.1 
 
 
385 aa  481  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  64.81 
 
 
379 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  65.25 
 
 
377 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  63.3 
 
 
378 aa  470  1e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  49.73 
 
 
374 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.39786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  49.47 
 
 
374 aa  358  1e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  47.9 
 
 
394 aa  326  4e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  47.77 
 
 
393 aa  322  1e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  43.19 
 
 
387 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  44.91 
 
 
395 aa  275  1e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.4 
 
 
405 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  43.72 
 
 
392 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  38.52 
 
 
404 aa  244  2e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  38.18 
 
 
462 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  38.28 
 
 
404 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.67 
 
 
319 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  39.95 
 
 
390 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  39.95 
 
 
390 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  40.51 
 
 
376 aa  232  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  38.56 
 
 
383 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59197e-07 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  39.24 
 
 
380 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  38.52 
 
 
356 aa  220  2e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  38.44 
 
 
375 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  65.85 
 
 
485 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  65.24 
 
 
484 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  38.29 
 
 
437 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  37.65 
 
 
420 aa  217  3e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  39.1 
 
 
386 aa  217  3e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  38.73 
 
 
327 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  59.2 
 
 
482 aa  213  3e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  64.07 
 
 
468 aa  213  4e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  62.36 
 
 
517 aa  213  6e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  59.77 
 
 
481 aa  212  8e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  63.47 
 
 
467 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  60.11 
 
 
516 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  38.5 
 
 
404 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  60.24 
 
 
687 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  37.53 
 
 
412 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  58.9 
 
 
488 aa  201  2e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  37.95 
 
 
369 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  37.95 
 
 
369 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  57.49 
 
 
492 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  38 
 
 
390 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  45.19 
 
 
483 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  34.95 
 
 
386 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  60.25 
 
 
272 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  60.25 
 
 
272 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  38.35 
 
 
412 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  34.79 
 
 
389 aa  190  3e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 
294 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  58.9 
 
 
294 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  35.09 
 
 
387 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  50.75 
 
 
475 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  59.88 
 
 
274 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  50.25 
 
 
475 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  35.09 
 
 
384 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  35.09 
 
 
384 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  59.26 
 
 
274 aa  185  1e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  50.26 
 
 
494 aa  184  2e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 
275 aa  184  2e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  58.28 
 
 
273 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  58.02 
 
 
275 aa  183  4e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  57.14 
 
 
270 aa  183  4e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  53.61 
 
 
492 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  38.77 
 
 
385 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  55.09 
 
 
490 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  57.67 
 
 
272 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  34.99 
 
 
391 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  59.26 
 
 
273 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  49.04 
 
 
273 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0172  flagellin-like  36.66 
 
 
392 aa  180  3e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  56.79 
 
 
273 aa  179  6e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  56.17 
 
 
273 aa  179  6e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  54.17 
 
 
492 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.49 
 
 
276 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  51.93 
 
 
493 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  43.98 
 
 
580 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>