More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1761 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1761  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000319671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01245  peptidyl-tRNA hydrolase  89.8 
 
 		 196 aa  348  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004208  peptidyl-tRNA hydrolase  88.78 
 
 		 196 aa  347  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0785  peptidyl-tRNA hydrolase  82.65 
 
 		 196 aa  321  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000418835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2570  peptidyl-tRNA hydrolase  68.75 
 
 		 194 aa  285  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0909  aminoacyl-tRNA hydrolase  70.92 
 
 		 197 aa  277  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2572  peptidyl-tRNA hydrolase  71.35 
 
 		 195 aa  274  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102375  normal  0.060871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3258  peptidyl-tRNA hydrolase  72.45 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00539535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1109  peptidyl-tRNA hydrolase  72.45 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00116388  hitchhiker  0.000000000970821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3436  peptidyl-tRNA hydrolase  72.45 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0164133  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3300  peptidyl-tRNA hydrolase  72.45 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1007  peptidyl-tRNA hydrolase  70.92 
 
 		 195 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149931  normal  0.240982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1072  peptidyl-tRNA hydrolase  70.92 
 
 		 195 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0876072  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1184  peptidyl-tRNA hydrolase  70.92 
 
 		 195 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2853  peptidyl-tRNA hydrolase  70.41 
 
 		 195 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000370002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1011  peptidyl-tRNA hydrolase  71.35 
 
 		 195 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00579564  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0818  peptidyl-tRNA hydrolase  69.79 
 
 		 195 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000832673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2344  peptidyl-tRNA hydrolase  69.27 
 
 		 194 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0716  peptidyl-tRNA hydrolase  68.75 
 
 		 195 aa  258  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0115669  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1354  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00856454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1922  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1984  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 196 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0267905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1916  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.295058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01179  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2443  Aminoacyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0491513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1538  peptidyl-tRNA hydrolase  66.67 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal  0.044149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1685  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  0.435145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  normal  0.097849 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01189  hypothetical protein  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2422  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0426078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1351  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1309  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 194 aa  254  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1980  peptidyl-tRNA hydrolase  66.67 
 
 		 194 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0660178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02582  peptidyl-tRNA hydrolase  60 
 
 		 193 aa  250  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00538326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3559  peptidyl-tRNA hydrolase  65.62 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2467  peptidyl-tRNA hydrolase  67.71 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.988822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3134  peptidyl-tRNA hydrolase  64.92 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000686708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2074  peptidyl-tRNA hydrolase  67.71 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2186  peptidyl-tRNA hydrolase  67.71 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1850  peptidyl-tRNA hydrolase  68.59 
 
 		 195 aa  247  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2413  peptidyl-tRNA hydrolase  68.59 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.943472  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3468  peptidyl-tRNA hydrolase  64.21 
 
 		 194 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000174641  normal  0.19866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2120  peptidyl-tRNA hydrolase  68.42 
 
 		 195 aa  245  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0277037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2064  peptidyl-tRNA hydrolase  67.19 
 
 		 195 aa  244  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1368  peptidyl-tRNA hydrolase  66.67 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00538559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2920  peptidyl-tRNA hydrolase  63.35 
 
 		 195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374558  normal  0.0910923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3693  peptidyl-tRNA hydrolase  62.3 
 
 		 194 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000643435  normal  0.128415 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0504  peptidyl-tRNA hydrolase  63.08 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1053  peptidyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 196 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0294  peptidyl-tRNA hydrolase  53.19 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3606  peptidyl-tRNA hydrolase  58.12 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00295121  normal  0.0514505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  55.03 
 
 		 192 aa  211  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5322  peptidyl-tRNA hydrolase  56.54 
 
 		 194 aa  210  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61790  peptidyl-tRNA hydrolase  56.54 
 
 		 194 aa  210  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0172217  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0720  peptidyl-tRNA hydrolase  58.12 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4755  peptidyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 194 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215279  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0754  peptidyl-tRNA hydrolase  58.12 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4463  peptidyl-tRNA hydrolase  57.59 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0764  peptidyl-tRNA hydrolase  57.59 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0942  peptidyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 194 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1102  peptidyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 194 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41540  peptidyl-tRNA hydrolase  55.5 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  52.66 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 		 193 aa  197  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1522  peptidyl-tRNA hydrolase  51.83 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0197498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  49.48 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  50.53 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  51.58 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  51.31 
 
 		 192 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  48.4 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  51.06 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  46.88 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  48.42 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  48.4 
 
 		 213 aa  184  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2367  aminoacyl-tRNA hydrolase  57.22 
 
 		 196 aa  184  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3258  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 187 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  48.4 
 
 		 192 aa  181  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0248  peptidyl-tRNA hydrolase  54 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0275  peptidyl-tRNA hydrolase  53.47 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 		 193 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0340  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0285  peptidyl-tRNA hydrolase  47.89 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0393  peptidyl-tRNA hydrolase  51.76 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2042  peptidyl-tRNA hydrolase  48.96 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0987  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 		 194 aa  167  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0071  peptidyl-tRNA hydrolase  48.96 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2107  peptidyl-tRNA hydrolase  49.24 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0023185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0287  peptidyl-tRNA hydrolase  47.45 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>