More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1592 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 314 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  79.55 
 
 		 313 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  78.98 
 
 		 317 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  73.57 
 
 		 313 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  71.97 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  71.02 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  71.02 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  70.7 
 
 		 314 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  70.7 
 
 		 314 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  70.7 
 
 		 314 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  71.02 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  70.38 
 
 		 314 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  70.06 
 
 		 314 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  70 
 
 		 317 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  67.73 
 
 		 312 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  68.17 
 
 		 314 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  68.47 
 
 		 313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  67.41 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  67.52 
 
 		 313 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  65.18 
 
 		 319 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  67.83 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  59.11 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  59.22 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  58.25 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  59.55 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  57.61 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  57.61 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  57.61 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  57.61 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  57.14 
 
 		 311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  52.26 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  52.41 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  52.58 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  52.26 
 
 		 309 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  51.94 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  52.4 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  52.08 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  51.61 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  49.35 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  50.32 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  50.32 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  49.84 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  49.03 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  292  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  50.49 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  49.68 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  48.39 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  51.12 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  49.17 
 
 		 306 aa  288  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  48.71 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  48.71 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  48.39 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  48.06 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  48.68 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  48.36 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  46.62 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  46.91 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  46.5 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  48.04 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  46.35 
 
 		 312 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  45.4 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  46.15 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  46.67 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  42.86 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  45.86 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  45.86 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  45.05 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  41.59 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  48.19 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  36.36 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.36 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.5 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  35.17 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  36.34 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  33.7 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  37.42 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  34.27 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  34.09 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  34.06 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  34.54 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  34.62 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  34.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  38.38 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  36.91 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  38.25 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.75 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  33.92 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  33.92 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  33.92 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  34.15 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  34.78 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  34.78 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>