More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1574 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  72.69 
 
 
233 aa  348  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  72.27 
 
 
233 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  66.81 
 
 
233 aa  310  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  58.05 
 
 
231 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  58.05 
 
 
231 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  58.05 
 
 
231 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  58.51 
 
 
233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  57.63 
 
 
231 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  57.63 
 
 
231 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  57.81 
 
 
233 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  56.3 
 
 
233 aa  258  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  55.51 
 
 
231 aa  257  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  55.51 
 
 
231 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  58.82 
 
 
233 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  55.74 
 
 
231 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  55.7 
 
 
232 aa  255  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  57.98 
 
 
233 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  55.7 
 
 
232 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  55.7 
 
 
232 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  55.08 
 
 
231 aa  255  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  55.08 
 
 
231 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  55.08 
 
 
231 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  54.66 
 
 
231 aa  254  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  54.66 
 
 
231 aa  254  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  54.66 
 
 
231 aa  254  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  54.66 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  52.32 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  48.56 
 
 
239 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  51.69 
 
 
233 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  48.73 
 
 
239 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  51.48 
 
 
232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  47.88 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  49.57 
 
 
236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  48.73 
 
 
238 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  51.9 
 
 
237 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  51.9 
 
 
237 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  51.9 
 
 
237 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  51.9 
 
 
237 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  50.62 
 
 
236 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 
236 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  50.42 
 
 
236 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 
236 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  50.42 
 
 
236 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  45.87 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  48.98 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  49.34 
 
 
224 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  49.78 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  50.44 
 
 
226 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  48.91 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  49.56 
 
 
226 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  48.91 
 
 
224 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  48.47 
 
 
224 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  46.89 
 
 
234 aa  188  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  48.03 
 
 
224 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  46.72 
 
 
224 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  48.47 
 
 
224 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  46.67 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  45.73 
 
 
228 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  45.49 
 
 
223 aa  174  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  46.49 
 
 
225 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  43.83 
 
 
235 aa  174  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  46.12 
 
 
228 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  46.25 
 
 
233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  38.6 
 
 
226 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  38.6 
 
 
226 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  44.39 
 
 
266 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  41.45 
 
 
237 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40.77 
 
 
231 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  41.99 
 
 
239 aa  148  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  40.43 
 
 
223 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  44.83 
 
 
229 aa  148  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  38.03 
 
 
230 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  41.74 
 
 
237 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  41.74 
 
 
229 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  35.54 
 
 
235 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  40.43 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  40.43 
 
 
229 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  40.08 
 
 
233 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  36.24 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  39.5 
 
 
246 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  40.52 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  37.99 
 
 
220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  36.02 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  38.77 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  32.34 
 
 
236 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  39.92 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  37.7 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  45.34 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  37.7 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  37.7 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  37.55 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  37.7 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  36.63 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  37.5 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1984  peptidase M22, glycoprotease  35.1 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  36.63 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  36.63 
 
 
256 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>