56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1548 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  100 
 
 		 163 aa  335  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  50.88 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  42.7 
 
 		 178 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  42.42 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  41.1 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  39.51 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  39.51 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  36.2 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  38.89 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.26 
 
 		 278 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  38.1 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  37.5 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  36.9 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  36.9 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  41.71 
 
 		 202 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  41.3 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  40.14 
 
 		 169 aa  97.1  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  41.27 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  37.6 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  37.6 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2757  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.91 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.28 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  32.28 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.28 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.28 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.28 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.28 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.451187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  32.28 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.65 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  31.34 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  36.73 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.38 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.38 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.38 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.38 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.38 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  40.66 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  38.24 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.33 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  42.7 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.76 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.76 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.76 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  34.39 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  33.59 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0802  copper homeostasis protein CutF  29.17 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000203598  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0906  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  35.16 
 
 		 401 aa  53.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2958  hypothetical protein  36.51 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1191  hypothetical protein  25.61 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.940738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2012  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3143  hypothetical protein  28.74 
 
 		 203 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>