164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1547 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
87 aa  174  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.49363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004088  cell division topological specificity factor MinE  91.95 
 
 
87 aa  163  7e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.45291e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01383  cell division topological specificity factor MinE  89.66 
 
 
87 aa  160  5e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1065  cell division topological specificity factor MinE  69.77 
 
 
86 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00330436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  67.82 
 
 
94 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1938  cell division topological specificity factor MinE  67.82 
 
 
89 aa  116  8e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  1.67283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  66.67 
 
 
89 aa  115  1e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.01972e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1995  cell division topological specificity factor MinE  69.05 
 
 
97 aa  114  4e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0206269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2758  cell division topological specificity factor MinE  64.37 
 
 
89 aa  112  2e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  7.33452e-11  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2012  cell division topological specificity factor MinE  64.37 
 
 
89 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.22247e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2123  cell division topological specificity factor MinE  64.37 
 
 
89 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2401  cell division topological specificity factor MinE  64.37 
 
 
89 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.42715e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1501  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00311098  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1317  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  6.76449e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1958  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  7.38777e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2015  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00111528  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1955  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00065968  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1318  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.49629e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2373  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
89 aa  108  4e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116019  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.36867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2451  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013446  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01149  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01159  hypothetical protein  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1659  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  3.95345e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1327  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000455386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1975  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
88 aa  107  4e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220413  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  56.98 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  2.71778e-11 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.55789e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  52.87 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.4687e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  54.65 
 
 
88 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.60845e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.16075e-09  hitchhiker  2.19314e-05 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  53.49 
 
 
84 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 
85 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.38663e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 
85 aa  87.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 
85 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.03577e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 
85 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.4177e-09  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 
85 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  2.26469e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.81978e-06  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0446  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.089748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 
86 aa  84.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2446  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.25931e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
85 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.06409e-07  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
85 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.38456e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
85 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.16087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
85 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.10514e-07  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
84 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
84 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
84 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
84 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2583  cell division topological specificity factor MinE  47.19 
 
 
92 aa  82.8  1e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  48.86 
 
 
87 aa  82  2e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
85 aa  81.6  3e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  49.41 
 
 
84 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 
84 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 
84 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
86 aa  80.5  7e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  47.62 
 
 
96 aa  80.1  9e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 
84 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  48.24 
 
 
88 aa  79.7  1e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
89 aa  78.6  2e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
89 aa  78.6  2e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  49.41 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
87 aa  77  9e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
83 aa  76.3  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
86 aa  76.3  1e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  47.62 
 
 
88 aa  76.3  1e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 
83 aa  76.3  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
93 aa  76.3  1e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  48.24 
 
 
88 aa  75.9  2e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  48.24 
 
 
88 aa  75.9  2e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  49.41 
 
 
83 aa  74.3  5e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  48.24 
 
 
84 aa  74.3  5e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.3438e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  47.62 
 
 
88 aa  73.9  7e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  72.8  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  72.8  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  73.2  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  73.2  1e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  72.8  1e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  73.2  1e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  73.2  1e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  44.58 
 
 
84 aa  72  3e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  45.45 
 
 
89 aa  71.2  4e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 
88 aa  71.6  4e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2337  cell division topological specificity factor MinE  53.57 
 
 
83 aa  71.2  4e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  42.53 
 
 
84 aa  70.9  5e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  45.78 
 
 
84 aa  70.9  5e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>