More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1543 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 323 aa  669    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  75.54 
 
 		 323 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  75.54 
 
 		 323 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  66.87 
 
 		 324 aa  451  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  60.13 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  52.71 
 
 		 347 aa  363  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  54.63 
 
 		 323 aa  358  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  52.34 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  52.35 
 
 		 346 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  50.83 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  46.56 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  48.66 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  48.66 
 
 		 361 aa  311  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  48.32 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  45.71 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1904  lytic murein transglycosylase  45.25 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.025136  normal  0.972057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2422  lytic murein transglycosylase  44.94 
 
 		 370 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000759063  hitchhiker  0.00536739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1870  lytic murein transglycosylase  44.62 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000324668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1897  lytic murein transglycosylase  42.68 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000349949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  42.9 
 
 		 438 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  42.9 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  42.9 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  42.58 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  40.57 
 
 		 396 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  43.81 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2116  lytic murein transglycosylase  42.5 
 
 		 329 aa  265  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286626  normal  0.0851142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 		 377 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  38.59 
 
 		 424 aa  261  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 430 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 439 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 424 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.83 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  40.25 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2171  putative transglycosylase  42.41 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000761177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.56 
 
 		 333 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  43.46 
 
 		 454 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  41.88 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2248  putative transglycosylase  42.41 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00479266  normal  0.458492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  40.33 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2380  putative transglycosylase  42.09 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00018447  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.79 
 
 		 421 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  39.46 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  39.5 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.59 
 
 		 401 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  39.5 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  41.86 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  41.47 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  41.37 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  41.07 
 
 		 438 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  41.37 
 
 		 417 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  42.67 
 
 		 448 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 		 438 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  40.8 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  40.71 
 
 		 409 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  42.22 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  41.14 
 
 		 445 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  36.59 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 427 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 455 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.64 
 
 		 438 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  40.72 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  43.19 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  40.07 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.31 
 
 		 438 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.47 
 
 		 438 aa  238  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  39.74 
 
 		 470 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  39.8 
 
 		 457 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 		 432 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  39.54 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  39.14 
 
 		 363 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  38.41 
 
 		 395 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  36.27 
 
 		 415 aa  228  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2182  putative transglycosylase  39.82 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00884137  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1739  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  41.53 
 
 		 418 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  37.12 
 
 		 422 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 		 434 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1928  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.74 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  39.87 
 
 		 474 aa  221  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.16 
 
 		 417 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  36.22 
 
 		 417 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  36.3 
 
 		 720 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 466 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  35.83 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  34.7 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  36.6 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 393 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  36.63 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 413 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 393 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37 
 
 		 462 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  36.29 
 
 		 427 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  36.48 
 
 		 514 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  38.33 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  36.33 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  38.28 
 
 		 391 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>