166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1540 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002720  chitinase  70.33 
 
 		 848 aa  1243    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  64.57 
 
 		 846 aa  1161    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  100 
 
 		 846 aa  1721    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  72.16 
 
 		 846 aa  1266    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  68.54 
 
 		 543 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  35.09 
 
 		 1362 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  37.31 
 
 		 680 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  41.03 
 
 		 360 aa  217  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  41.03 
 
 		 360 aa  217  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  41.03 
 
 		 360 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  40.24 
 
 		 360 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  36.18 
 
 		 1152 aa  210  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  41.09 
 
 		 360 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  40.61 
 
 		 360 aa  207  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  40.91 
 
 		 360 aa  206  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  40.61 
 
 		 360 aa  204  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  40.96 
 
 		 360 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.39 
 
 		 510 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  30.76 
 
 		 1578 aa  190  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.23 
 
 		 648 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  35.23 
 
 		 376 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  35.09 
 
 		 341 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  40.3 
 
 		 1051 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  33.43 
 
 		 613 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  31.37 
 
 		 420 aa  168  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  33.96 
 
 		 468 aa  168  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  29.41 
 
 		 962 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  38.1 
 
 		 1053 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  37.05 
 
 		 1127 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  37.05 
 
 		 1127 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 		 1127 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 		 1127 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  37.68 
 
 		 1054 aa  154  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 1129 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  33.59 
 
 		 460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  32.6 
 
 		 1285 aa  144  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  41.88 
 
 		 1146 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  30.03 
 
 		 565 aa  123  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  28.1 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.91 
 
 		 729 aa  119  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.91 
 
 		 729 aa  119  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 727 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  30.89 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  31.43 
 
 		 1219 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  38.27 
 
 		 1123 aa  114  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1406 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  27.5 
 
 		 471 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  29.58 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.59 
 
 		 703 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  29.18 
 
 		 483 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  28.53 
 
 		 483 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.61 
 
 		 598 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  28.05 
 
 		 782 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.14 
 
 		 551 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.64 
 
 		 782 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  43.37 
 
 		 174 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  43.55 
 
 		 189 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  25.74 
 
 		 353 aa  99  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.69 
 
 		 803 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.7 
 
 		 1059 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.43 
 
 		 816 aa  97.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  39.47 
 
 		 245 aa  95.5  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  30.79 
 
 		 675 aa  94.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  41.58 
 
 		 1047 aa  94.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  35 
 
 		 306 aa  88.2  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  29.02 
 
 		 1096 aa  88.2  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 1224 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  27.93 
 
 		 1057 aa  84.7  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  25.5 
 
 		 792 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  29.9 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  37.14 
 
 		 499 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  37.07 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1204 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  31.22 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.48 
 
 		 587 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40.82 
 
 		 767 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  49.21 
 
 		 1113 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  43.68 
 
 		 778 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.03 
 
 		 12684 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  49.45 
 
 		 1132 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  29.76 
 
 		 1113 aa  71.6  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.25 
 
 		 984 aa  70.1  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  34.13 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  43.69 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  39.2 
 
 		 991 aa  68.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1452 aa  67.8  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  26.26 
 
 		 1141 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  41.05 
 
 		 1204 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  30.1 
 
 		 14944 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.13 
 
 		 915 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.89 
 
 		 979 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  38.02 
 
 		 1601 aa  63.9  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  41.67 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  41.18 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  40.74 
 
 		 1414 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  32.95 
 
 		 827 aa  61.6  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>