196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1539 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  81.32 
 
 
364 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  100 
 
 
368 aa  776    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  80.22 
 
 
364 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  51.79 
 
 
366 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  50.96 
 
 
366 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  51.52 
 
 
366 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  51.52 
 
 
366 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  51.24 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  50.96 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  51.24 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  50.69 
 
 
366 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  50.69 
 
 
366 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  40.46 
 
 
386 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  39.39 
 
 
378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  37.81 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  37.27 
 
 
394 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.27 
 
 
394 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.27 
 
 
394 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.27 
 
 
394 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.36 
 
 
394 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  37.53 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.26 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  37.26 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.26 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  37.26 
 
 
390 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  36.99 
 
 
390 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  36.99 
 
 
390 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  36.56 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.56 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  35.34 
 
 
361 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4219  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  35.96 
 
 
359 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  34.38 
 
 
392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0656  NapC/NirT cytochrome c-like  34.19 
 
 
389 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  33.61 
 
 
385 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  32.61 
 
 
391 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  30.41 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.25 
 
 
392 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2730  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  32.8 
 
 
407 aa  186  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  30.53 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  30 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.72 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  30.47 
 
 
392 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.72 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.72 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.72 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0773  cytochrome c-type protein  30.27 
 
 
392 aa  179  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.72 
 
 
392 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.72 
 
 
392 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1297  cytochrome c-type protein TorC  28.49 
 
 
394 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.44 
 
 
392 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2797  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.97 
 
 
392 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  28.2 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.33 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0988  tetraheme cytochrome c  29.49 
 
 
391 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003826  cytochrome c-type protein TorY  27.76 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  43.45 
 
 
203 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  45.61 
 
 
603 aa  162  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.11 
 
 
411 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.460429  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  43.37 
 
 
191 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  42.26 
 
 
200 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2617  NapC/NirT cytochrome c domain protein  43.29 
 
 
203 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  42.86 
 
 
200 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  44.97 
 
 
196 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3218  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.02 
 
 
234 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1339  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  43.53 
 
 
233 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  42.61 
 
 
202 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  40.88 
 
 
215 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  41.67 
 
 
200 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  41.67 
 
 
199 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  41.67 
 
 
199 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  40.24 
 
 
195 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05375  cytochrome c-type protein NapC  41.24 
 
 
192 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  42.26 
 
 
200 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  39.04 
 
 
237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  42.26 
 
 
200 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4005  NapC/NirT cytochrome c domain protein  40.59 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1915  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  40.91 
 
 
196 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000371882  normal  0.91066 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0619  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  41.81 
 
 
191 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1587  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  40.74 
 
 
196 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1055  cytochrome c-type protein NapC  40.24 
 
 
195 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2678  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  38.95 
 
 
199 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.401671  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4061  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome NapC/NirT  39.64 
 
 
195 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418249  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2551  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family protein  39.64 
 
 
199 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.476596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2425  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  40.53 
 
 
199 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4765  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  38.1 
 
 
195 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.719721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1624  periplasmic nitrate reductase C-type cytochrome, NapC/NirT  40.24 
 
 
195 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.123114  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1772  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  39.64 
 
 
195 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4075  NapC/NirT cytochrome c-like  42.17 
 
 
198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>