31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1477 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  63.9 
 
 
242 aa  321  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  61.16 
 
 
243 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  43.96 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  26.62 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  35.42 
 
 
312 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  35.75 
 
 
333 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  35.75 
 
 
333 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  35.75 
 
 
333 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  35.75 
 
 
333 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  31.96 
 
 
335 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  30.97 
 
 
382 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  30.59 
 
 
343 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  30.28 
 
 
341 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  30.14 
 
 
332 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  25.68 
 
 
394 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  30.59 
 
 
342 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  29.65 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  32.81 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  28.22 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  26.34 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  26.21 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  29.3 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  23.02 
 
 
475 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  21.74 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  26.72 
 
 
509 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  24.63 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  27 
 
 
565 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  32.53 
 
 
168 aa  45.8  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  32.53 
 
 
168 aa  45.8  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>