88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1433 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1433  short chain acyl-CoA thioesterase YbgC  100 
 
 		 51 aa  100  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  6.78998e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  71.43 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  69.39 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  48 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  50 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.75 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  46.94 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.17 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.9 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.28 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.98 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.98 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.17 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.75 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.75 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2384  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.08 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29549  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.28 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.68 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.28 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.75 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.94 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.94 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  45.83 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.9 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  46.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  44.68 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.55 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.67 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2568  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.83 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.9 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  53.06 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1853  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.9 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107665  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  50 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  53.19 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.16 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.68 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.9 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.62 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.4 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.66 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.58 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  44.9 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  38.78 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  38.78 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  38.78 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  38.78 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  38.78 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  38.78 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  38.78 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.22 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.31 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.82 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.06 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.62 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.67 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  48.94 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.94 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  40 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  44.68 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  46.67 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>