31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1403 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  663    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  23.74 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  23.29 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  25.34 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  35.42 
 
 		 629 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  25.34 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  43.75 
 
 		 650 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  24.86 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  25 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  24.89 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  23.9 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  23.53 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  25.57 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  25.57 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  22.09 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  21.05 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  24.46 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  25.57 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  24.43 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  23.08 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  42.19 
 
 		 635 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.55 
 
 		 637 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  30.89 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  33.01 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  34.48 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  31.34 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  42.03 
 
 		 614 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  36.99 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  35.29 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  29.55 
 
 		 404 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  29.55 
 
 		 404 aa  42.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>