197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1321 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  78.66 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  76.28 
 
 		 268 aa  371  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  59.6 
 
 		 287 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  45.74 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  44.25 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  42.31 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  42.02 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  42.41 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  39.92 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  42.31 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  41.7 
 
 		 258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  41.31 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  41.31 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  41.31 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  41.31 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  34.66 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  41.54 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  37.78 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  31.82 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  36.72 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  34.25 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  35.69 
 
 		 248 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  36 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  35.29 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  34.78 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  37.88 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  35.06 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  36.8 
 
 		 251 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  34.47 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  33.82 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  35 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  34.62 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  36.79 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  37.57 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  34.42 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  33.73 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  36.04 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  33.59 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  33.65 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  26.59 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 242 aa  85.9  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.03 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.42 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.98 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31.52 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.06 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.06 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.79 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.05 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  26.92 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.38 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.51 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.22 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  29.46 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.2 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  27.85 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  29.46 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  25.22 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  29.02 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  34.52 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  30.8 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  28.77 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  25.87 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  24.61 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  31.36 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.74 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  29.58 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.12 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  31.22 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.31 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  31.36 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  25.93 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  28.52 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  31.41 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  26.12 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  32.35 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.51 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  25.23 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  30.81 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  32.03 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  35.17 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.27 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.18 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.89 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  30.07 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>