287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1320 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  100 
 
 		 260 aa  543  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  77.91 
 
 		 263 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  77.13 
 
 		 263 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  68.34 
 
 		 259 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  63.3 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  49.61 
 
 		 261 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  49.61 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  50.58 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  50.19 
 
 		 267 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  50.19 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  50.19 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  50.19 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  50.78 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  50 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  48.83 
 
 		 261 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  50 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  48.83 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  48.44 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  48.44 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  47.27 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  47.27 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  41.83 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  41.83 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  41.04 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  41.83 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  40.71 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  43.24 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  40.62 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  38.04 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  37.85 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  38.31 
 
 		 249 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  35.57 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  34.11 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  37.35 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  38.4 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  36 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  36.4 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  35.6 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  36 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  35.6 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  35.6 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  32.95 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  35.6 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  42.53 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  34.13 
 
 		 221 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  27.15 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  28.94 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  26.46 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  26.67 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  27.5 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  21.43 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  24.32 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  24.88 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.73 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.16 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.28 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.33 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.86 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  24.41 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.48 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.33 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.44 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  22.27 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.93 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.93 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.89 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.32 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  32.43 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.27 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>