74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1267 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  184  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  68.18 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  69.32 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  56.79 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  55.13 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  69.35 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  58.67 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  67.74 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  64.52 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  64.52 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  67.74 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  66.13 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  64.52 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  64.52 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  64.52 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  66.67 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  59.02 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  51.95 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  56.67 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  48.72 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  47.44 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  54.24 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  54.24 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  54.24 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  54.24 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  54.24 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  51.72 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  51.72 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  50.63 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  60 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  52.94 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  44.71 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  42.65 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  46.58 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  46.48 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  46.58 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  55.56 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  48.84 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  37.04 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  39.29 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  38.78 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  38.18 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  45.65 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  36.54 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  39.58 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  36.54 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  46.67 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  40.74 
 
 		 74 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  32.56 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  40.91 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  35.19 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  35.19 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  35.19 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  35.19 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  38.33 
 
 		 61 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  35.42 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.18 
 
 		 267 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  41.3 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  42 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  35.42 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  41.82 
 
 		 144 aa  40  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  37.21 
 
 		 61 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  37.21 
 
 		 61 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>