More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1237 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  71.99 
 
 		 458 aa  663    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  70.83 
 
 		 458 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  69.87 
 
 		 459 aa  653    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  919    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  32.82 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  31.64 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  35.28 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  33.84 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 445 aa  237  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  31.91 
 
 		 455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 458 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 479 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  29.64 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  28.71 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  24.68 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.23 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.23 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.23 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 477 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  20.84 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 454 aa  96.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 475 aa  96.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  25.5 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  23.33 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  23.33 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 468 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  22.34 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.7 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.73 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  24.22 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  23.88 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  23.88 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  24.56 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  24.76 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  23 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  24.45 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  24.45 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  25 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  24.45 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>