105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1235 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  100 
 
 		 836 aa  1706    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  69.28 
 
 		 817 aa  1197    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  54.59 
 
 		 817 aa  922    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  69.28 
 
 		 817 aa  1202    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.38 
 
 		 879 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  29.03 
 
 		 889 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  31.59 
 
 		 820 aa  295  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.6 
 
 		 889 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 884 aa  290  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  30.21 
 
 		 840 aa  286  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  30.11 
 
 		 819 aa  281  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.51 
 
 		 887 aa  278  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  30.37 
 
 		 820 aa  278  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  28.66 
 
 		 836 aa  277  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  28.86 
 
 		 849 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  28.09 
 
 		 865 aa  273  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.14 
 
 		 836 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  31.01 
 
 		 850 aa  270  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  28.8 
 
 		 887 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  29.16 
 
 		 897 aa  268  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  29.51 
 
 		 889 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  28.47 
 
 		 878 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  31.32 
 
 		 800 aa  259  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 821 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.77 
 
 		 821 aa  257  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  28.52 
 
 		 821 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  29.6 
 
 		 845 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.78 
 
 		 849 aa  247  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 800 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  29.16 
 
 		 821 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 		 803 aa  230  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.5 
 
 		 802 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.72 
 
 		 804 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.67 
 
 		 813 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  26.74 
 
 		 793 aa  207  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.75 
 
 		 850 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.56 
 
 		 855 aa  193  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 847 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 837 aa  181  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.2 
 
 		 866 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.65 
 
 		 870 aa  161  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 847 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.63 
 
 		 843 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  34.34 
 
 		 826 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  33.43 
 
 		 815 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  32.33 
 
 		 825 aa  131  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  26.88 
 
 		 929 aa  128  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  32.23 
 
 		 819 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  30.19 
 
 		 819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  31 
 
 		 846 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  26.36 
 
 		 842 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  29.92 
 
 		 819 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 		 842 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  30.38 
 
 		 872 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 842 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  32.87 
 
 		 795 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  25.56 
 
 		 841 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.47 
 
 		 858 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.11 
 
 		 858 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.91 
 
 		 820 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  26.34 
 
 		 843 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.67 
 
 		 846 aa  100  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  23.32 
 
 		 753 aa  93.6  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  32.61 
 
 		 795 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 		 884 aa  91.3  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  32.69 
 
 		 795 aa  88.6  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  22.28 
 
 		 857 aa  88.2  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  23.95 
 
 		 855 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  31.09 
 
 		 845 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  24.78 
 
 		 844 aa  78.2  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  22.89 
 
 		 867 aa  74.7  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.53 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.33 
 
 		 839 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  23.3 
 
 		 868 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  21.94 
 
 		 866 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  25.52 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  22.44 
 
 		 855 aa  64.3  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.03 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  24.55 
 
 		 877 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  21.55 
 
 		 861 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  19.84 
 
 		 851 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  20.87 
 
 		 850 aa  54.3  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.52 
 
 		 821 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 877 aa  50.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 859 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  22.75 
 
 		 825 aa  48.5  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 		 792 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.1 
 
 		 411 aa  48.5  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  22.58 
 
 		 849 aa  47.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  18.69 
 
 		 854 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  20.43 
 
 		 849 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.2 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.2 
 
 		 386 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 856 aa  47  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  24.85 
 
 		 402 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  21.47 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.16 
 
 		 416 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 		 386 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>