More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1229 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  100 
 
 		 212 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  60.29 
 
 		 208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  67.22 
 
 		 204 aa  262  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  65.56 
 
 		 204 aa  262  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  65.93 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  58.43 
 
 		 201 aa  224  9e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  54.82 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  45.35 
 
 		 201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  43.11 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  43.45 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  38.92 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  40.72 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  41.57 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  41.57 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  40.72 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  40.72 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  42.68 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  40.72 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  39.16 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  38.55 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  40.12 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  40.12 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 		 376 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 377 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 401 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 367 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 368 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  34.01 
 
 		 352 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  40.61 
 
 		 403 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  35.17 
 
 		 366 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.87 
 
 		 365 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 369 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.39 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.39 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  36.3 
 
 		 369 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.94 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  37.06 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.31 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  35.81 
 
 		 368 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 		 367 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  35.62 
 
 		 370 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 373 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 373 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  34.01 
 
 		 367 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 369 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  34.86 
 
 		 394 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.22 
 
 		 351 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.17 
 
 		 337 aa  96.3  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.66 
 
 		 337 aa  96.3  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  36.55 
 
 		 344 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.03 
 
 		 345 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 417 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  35.44 
 
 		 392 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.86 
 
 		 344 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.86 
 
 		 344 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.86 
 
 		 344 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.41 
 
 		 447 aa  91.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  32.05 
 
 		 333 aa  89.4  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.97 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  31.72 
 
 		 429 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  31.41 
 
 		 345 aa  86.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 380 aa  84.7  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.09 
 
 		 376 aa  84.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  30.12 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  35.1 
 
 		 375 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.86 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  29.71 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  34.64 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  31.61 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.83 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.83 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  28.12 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  31.33 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.5 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  28.43 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  35.58 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  32.12 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  31.43 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.95 
 
 		 631 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  33.33 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2021  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  33.33 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>