More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1212 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  79.26 
 
 		 326 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  80.19 
 
 		 326 aa  474  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  65.74 
 
 		 326 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  65.84 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  64.74 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  60.44 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  64.19 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  60.25 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  60.44 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  60.44 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  58.36 
 
 		 324 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  58.04 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  58.04 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  58.04 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  57.73 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  62.24 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  56.77 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  57.99 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  57.76 
 
 		 323 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  58.04 
 
 		 323 aa  342  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  56.63 
 
 		 323 aa  329  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  43.33 
 
 		 427 aa  260  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  49.5 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  42.72 
 
 		 326 aa  242  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  44.72 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  42.63 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  40.34 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  40.34 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  41.46 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  36.63 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  33.44 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  33.12 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 367 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  31.06 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  28.04 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.74 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.34 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.3 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  27.69 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.94 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  27.05 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.15 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  29.48 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  29.48 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  29.48 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  30.29 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  30.29 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  27.9 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  31.9 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  32.24 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  28.46 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  26.33 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.63 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  27.07 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  27.61 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.2 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.72 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  29.58 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.44 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  24.81 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  27.8 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  25.4 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  26.27 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  25.52 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  25.32 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.05 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.58 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  27.85 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.21 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  28.68 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25.76 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  28.93 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  24.2 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25.56 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  27.44 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  25.98 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>