More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1019 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  43.43 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  35.32 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  34 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.67 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.66 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  31.66 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 244 aa  94.4  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 		 230 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 231 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 216 aa  85.1  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  31.68 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  32.09 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.86 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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