More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1007 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  54.1 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  47.9 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  49.59 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  52.46 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  47.11 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  48.28 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03239  Response regulator receiver domain protein (CheY)  47.11 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  47.15 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  47.15 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  44.72 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  46.83 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  41.32 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  44.63 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  43.65 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  43.44 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  44.63 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  42.74 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  42.98 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  42.98 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  44.17 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  43.65 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  44.26 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 1155 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  38.02 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  43.8 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  45.08 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 1098 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 1098 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  41.18 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  42.15 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 1616 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  36.8 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1732  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  42.48 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>