More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0965 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 1331 aa  2747    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 		 1340 aa  1086    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1326 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 		 1165 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 		 1611 aa  589  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.29 
 
 		 2213 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 1548 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1622 aa  546  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1768 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.06 
 
 		 1245 aa  536  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  37.4 
 
 		 1765 aa  533  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 1782 aa  532  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  40.4 
 
 		 2035 aa  530  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 1784 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  39.68 
 
 		 1763 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1786 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1771 aa  530  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 1767 aa  530  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1767 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 1767 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  39.06 
 
 		 1030 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 1792 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 1765 aa  515  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 		 1683 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 1284 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  39.54 
 
 		 1439 aa  502  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.63 
 
 		 1009 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 1582 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 920 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 		 2654 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 1310 aa  493  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 1267 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 1128 aa  479  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 		 1021 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 1033 aa  476  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  38.93 
 
 		 1574 aa  465  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1245 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1193 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 916 aa  459  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 1659 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1166 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 1788 aa  455  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1303 aa  453  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 1234 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 1240 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  40.03 
 
 		 1188 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1238 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1266 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 957 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1236 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 1238 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 1238 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1236 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1236 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1245 aa  439  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 1238 aa  440  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1230 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 1234 aa  439  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 1603 aa  436  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  39.21 
 
 		 1200 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 1236 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 		 1236 aa  432  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.79 
 
 		 1287 aa  429  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1005 aa  429  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 981 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1369 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 		 1686 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.82 
 
 		 1135 aa  425  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 1625 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1681 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 		 1626 aa  422  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1681 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 1629 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.3 
 
 		 1233 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1069 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1333 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 1629 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1426 aa  409  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  38 
 
 		 1417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 833 aa  406  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 912 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  37.98 
 
 		 861 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 816 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  37.66 
 
 		 1418 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1303 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  36.13 
 
 		 1214 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.52 
 
 		 852 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 1632 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 964 aa  403  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.55 
 
 		 1053 aa  399  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.57 
 
 		 1468 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1480 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  34.18 
 
 		 1364 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 1202 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  37.16 
 
 		 1070 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 812 aa  396  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.86 
 
 		 858 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 1118 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>