More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0916 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003151  methyl-accepting chemotaxis protein  68.29 
 
 		 541 aa  749    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 543 aa  1113    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 		 535 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3300  methyl-accepting chemotaxis protein  32.34 
 
 		 535 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.3 
 
 		 541 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 634 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0926  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.55 
 
 		 539 aa  177  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.32 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 634 aa  174  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 		 552 aa  174  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  30.98 
 
 		 634 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 		 544 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 		 773 aa  169  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.54 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 637 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.39 
 
 		 650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  33.05 
 
 		 712 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 632 aa  163  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 		 495 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 544 aa  163  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.98 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.017789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  32.95 
 
 		 712 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 564 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  29.65 
 
 		 638 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1662  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.84 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.35 
 
 		 632 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 		 638 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 		 713 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  30.29 
 
 		 543 aa  157  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 540 aa  156  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0570  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 674 aa  156  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 544 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 640 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2526  methyl-accepting chemotaxis protein  29.28 
 
 		 559 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 		 634 aa  156  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 621 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.29 
 
 		 553 aa  156  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000172296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  30.65 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 632 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.76 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  35.69 
 
 		 720 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 568 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  32.87 
 
 		 559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 533 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 638 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 		 544 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 638 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  29.66 
 
 		 553 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 544 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 638 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  33.14 
 
 		 545 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4711  methyl-accepting chemotaxis protein  32.39 
 
 		 633 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 		 638 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 		 716 aa  153  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 		 572 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  29.58 
 
 		 553 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 633 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.05 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 681 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.79 
 
 		 674 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 637 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 633 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 633 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 620 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 		 620 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 545 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 545 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 		 631 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 		 620 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  31.4 
 
 		 578 aa  150  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 		 540 aa  150  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289047 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  32.25 
 
 		 542 aa  150  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 633 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 544 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 639 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  29.68 
 
 		 578 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 655 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.32 
 
 		 672 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  34.07 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  32.02 
 
 		 660 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 		 658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>