22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0847 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  69.5 
 
 
259 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  69.8 
 
 
256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  51.97 
 
 
256 aa  258  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  46.83 
 
 
261 aa  207  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  46.83 
 
 
261 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  46.43 
 
 
261 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  45.06 
 
 
261 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  44.66 
 
 
261 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  44.66 
 
 
261 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  46.03 
 
 
261 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  44.66 
 
 
261 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  45.06 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  44.44 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  44.44 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  47.06 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  44.84 
 
 
260 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  42.86 
 
 
266 aa  188  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  40.87 
 
 
259 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  26.7 
 
 
439 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  30 
 
 
1106 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  32 
 
 
646 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>