26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0821 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0821  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  500  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000458892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003724  hypothetical protein  82.99 
 
 
241 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000435899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02065  hypothetical protein  83.55 
 
 
241 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1766  hypothetical protein  66.52 
 
 
235 aa  325  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3197  hypothetical protein  46.12 
 
 
232 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3163  hypothetical protein  46.35 
 
 
252 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0591  hypothetical protein  48.26 
 
 
233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830224  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2539  hypothetical protein  44.64 
 
 
237 aa  221  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0631  hypothetical protein  46.35 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000129796  normal  0.0702813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2117  hypothetical protein  47.83 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0631  hypothetical protein  46.78 
 
 
233 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000012648  normal  0.149121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3398  hypothetical protein  46.78 
 
 
233 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000101097  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0714  hypothetical protein  46.35 
 
 
234 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000507099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0660  hypothetical protein  46.96 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3887  hypothetical protein  46.35 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0229924  normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3786  hypothetical protein  46.58 
 
 
233 aa  211  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100132  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4011  hypothetical protein  44.64 
 
 
233 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3119  hypothetical protein  46.35 
 
 
237 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000244362  unclonable  0.0000043186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3738  hypothetical protein  47 
 
 
233 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3864  hypothetical protein  47 
 
 
233 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0587  hypothetical protein  47 
 
 
233 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3681  hypothetical protein  47 
 
 
233 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1490  hypothetical protein  40.6 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0905179  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1335  hypothetical protein  42.29 
 
 
248 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0840  hypothetical protein  41.84 
 
 
251 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4402  hypothetical protein  39.91 
 
 
235 aa  188  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>