More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0815 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  78.83 
 
 		 222 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  70.72 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  78.9 
 
 		 219 aa  284  9e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  53.64 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  46.35 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  44.2 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  45.97 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  48 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  48 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  51.57 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  48.23 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  48.44 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  48.44 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  48.44 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  48.44 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  48.44 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  48.44 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  47.03 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  48 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40 
 
 		 205 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  46.05 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  43.98 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  43.38 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.39 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  48.59 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  48.95 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  44.5 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.01 
 
 		 228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.01 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.01 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  43.95 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  43.95 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.95 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  46.51 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  48.59 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  48.59 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  48.59 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  46.73 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  47.13 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  46.2 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  41.7 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  44.93 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  44.39 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  45.66 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.18 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  41.84 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.25 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  44.76 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  48.77 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  41.4 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.66 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  46.2 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  34.98 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  44.68 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  43.56 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  38.22 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  44.06 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  42.86 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.25 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.25 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.51 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  44.2 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  39.51 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  43.26 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  43.83 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  39.33 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  40 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  40.71 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>