More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0637 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0637  short chain dehydrogenase  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003864  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  60.17 
 
 
241 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.013707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  59.49 
 
 
241 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 
238 aa  224  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 
239 aa  221  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
266 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
240 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
266 aa  214  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0813  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.42 
 
 
253 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 
240 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.9 
 
 
275 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.88 
 
 
239 aa  205  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
239 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  41.88 
 
 
239 aa  201  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
266 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.857449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.94 
 
 
266 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
266 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
238 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
266 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
238 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.22 
 
 
251 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
250 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
260 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
252 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
250 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.87 
 
 
250 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
249 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
251 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
262 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
260 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
254 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
260 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2469  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
259 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
257 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0496  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4738  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1119  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.18 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
258 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
258 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0230  hypothetical protein  34.71 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.599536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  35.17 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
263 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  32.87 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
256 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
261 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
261 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6102  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
264 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0605001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
267 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
259 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
240 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
270 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05379  conserved hypothetical protein  31.19 
 
 
365 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.228242  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
249 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1087  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  30.22 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0379321  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2308  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>