More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0529 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  100 
 
 		 294 aa  610  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  78.64 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  77.29 
 
 		 293 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  65.75 
 
 		 292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  42.91 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 		 290 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.23 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  42.96 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  43.23 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  43.23 
 
 		 289 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  41.34 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  40.86 
 
 		 289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  40.49 
 
 		 290 aa  231  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  39.65 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  38.75 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  30.69 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  31.05 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  30.32 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  28.93 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  29.51 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  29.25 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  30.04 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  30.04 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  28 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.72 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  44.44 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.63 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  28.06 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.09 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.61 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  26.62 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.02 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.98 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  25.81 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  46.48 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  30.91 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  39.77 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  28.78 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  34.21 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  34.21 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  36.84 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  35.29 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  36.63 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  28.66 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 364 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.09 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  23.45 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  38.71 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.18 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  43.84 
 
 		 569 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 587 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.09 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.16 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  45.83 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.07 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2246  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  decreased coverage  0.00792288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  29.7 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 1026 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35.04 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  37.11 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  33.64 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.52 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.14 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.48 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 		 543 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  34.58 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  35.78 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 544 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  35.29 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  45.07 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  38.82 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  41.03 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  37.63 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  30.77 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.77 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>