165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0502 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  65.75 
 
 
181 aa  258  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  63.54 
 
 
181 aa  252  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  60.45 
 
 
183 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  59.89 
 
 
187 aa  228  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  62.43 
 
 
183 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  59.56 
 
 
183 aa  223  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  61.85 
 
 
183 aa  221  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  61.8 
 
 
183 aa  220  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  62.57 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  57.78 
 
 
183 aa  218  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  57.78 
 
 
183 aa  218  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  57.78 
 
 
183 aa  218  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  59.44 
 
 
193 aa  214  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  57.95 
 
 
184 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  57.95 
 
 
184 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.95 
 
 
183 aa  214  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  57.95 
 
 
183 aa  214  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  57.95 
 
 
183 aa  214  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  57.95 
 
 
183 aa  214  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  57.95 
 
 
183 aa  214  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  57.95 
 
 
183 aa  214  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  57.95 
 
 
183 aa  214  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  59.54 
 
 
183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  60 
 
 
185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  57.63 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  57.63 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  57.63 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  57.63 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  57.63 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  53.59 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  48.02 
 
 
182 aa  168  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  44.32 
 
 
187 aa  168  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  46.59 
 
 
188 aa  165  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  43.71 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.26 
 
 
182 aa  141  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  40.68 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  38.64 
 
 
185 aa  128  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  39.43 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  37.77 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  35.64 
 
 
187 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.5 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.14 
 
 
186 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  35.33 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  38.55 
 
 
196 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  34.62 
 
 
184 aa  110  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  43.23 
 
 
188 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  31.22 
 
 
184 aa  104  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.96 
 
 
180 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.64 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.15 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.53 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.14 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.75 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  40 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  27.62 
 
 
238 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  33.04 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.55 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  37 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.55 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  24.24 
 
 
225 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26 
 
 
232 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  35.29 
 
 
168 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.7 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.3 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.68 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  30.32 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.72 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  27.04 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.77 
 
 
222 aa  52.4  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  25.48 
 
 
233 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  37 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  24.12 
 
 
249 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  30 
 
 
169 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  27.51 
 
 
167 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
157 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.55 
 
 
162 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.85 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  23.92 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  28.71 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  26.46 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  26.46 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1649  metallophosphoesterase  27.5 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  26.46 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  26.46 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  29.36 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  26.46 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4785  metallophosphoesterase  24.29 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  26.94 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.54 
 
 
148 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  26.46 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.39 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  26.46 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 
234 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 
234 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  35.45 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>