More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0372 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  82.93 
 
 		 415 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  100 
 
 		 422 aa  877    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  77.32 
 
 		 414 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  71.15 
 
 		 413 aa  614  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  65.61 
 
 		 416 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  62.14 
 
 		 418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  61.89 
 
 		 419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  63.77 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  61.41 
 
 		 418 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  59.47 
 
 		 418 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  60.4 
 
 		 409 aa  534  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  62.98 
 
 		 408 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  62.13 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  56.23 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  56.35 
 
 		 410 aa  474  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  52.2 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  53.41 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  52.97 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  53.17 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  53.06 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  51.33 
 
 		 413 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  50.37 
 
 		 410 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  51.78 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  52.93 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  51.94 
 
 		 416 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  51.7 
 
 		 416 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  51.82 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  52.16 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  52.74 
 
 		 402 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  50.98 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  51.91 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  52.21 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  51.95 
 
 		 411 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  52.2 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  51.71 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  49.11 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  48.54 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  46.62 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  46.62 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  46.62 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  45 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  40.59 
 
 		 418 aa  333  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  40.95 
 
 		 413 aa  332  6e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  36.09 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  39.49 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.9 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  37.56 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  34.25 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  34.25 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  34.25 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  34.86 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  35.62 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  36.43 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  36.43 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  35.71 
 
 		 417 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.6 
 
 		 402 aa  276  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 438 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  36.53 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  36.05 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1358  integrase, truncation  92.2 
 
 		 158 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.760246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  36.53 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  33.67 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  34.18 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  36.28 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  37.05 
 
 		 387 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  33.5 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  36.98 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  36.67 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  36.34 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  35.57 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.83 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  34.05 
 
 		 420 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35.88 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  37.19 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  36.2 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.93 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.85 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  36.81 
 
 		 387 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  33.74 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  34.02 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  36.14 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  36.3 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.11 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  35.35 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.11 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  34.48 
 
 		 419 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  34.48 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  35.97 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  35.81 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  36.73 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.31 
 
 		 422 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  35.64 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  43.45 
 
 		 290 aa  253  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  36.09 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  35.1 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  34.6 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  34.6 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  35.09 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  33.33 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  34.92 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>