170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0338 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  71.35 
 
 		 192 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  53.65 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  54.26 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 222 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  41.67 
 
 		 1287 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  41.62 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  35.98 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  35.98 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  35.68 
 
 		 208 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  34.46 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  36.49 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  36.49 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  31.02 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  34.46 
 
 		 200 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  33.78 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  36.71 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.79 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.19 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  29.03 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  27.37 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 364 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  30.11 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  25.26 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  30.66 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  29.2 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  24.73 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  28.76 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  26.53 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.99 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  25 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  28.76 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  29.86 
 
 		 535 aa  54.7  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  26 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  28.8 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  28.8 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  29.6 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.64 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  27.64 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  27.64 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  27.64 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.32 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.31 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  28.8 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  28.8 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  31.62 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.31 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 551 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  25.64 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.87 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.28 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2349  hypothetical protein  42.42 
 
 		 85 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.504297  normal  0.779927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.94 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.27 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.66 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.69 
 
 		 296 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  29.9 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  23.75 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  23.97 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  25.66 
 
 		 390 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  29.9 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  29.9 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  29.9 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 319 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.64 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>