More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0317 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  100 
 
 		 230 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  47.58 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  49.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  47.37 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  47.37 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  47.37 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  47.37 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.49 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0056  transcriptional regulator CitB  46.32 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0058  transcriptional regulatory protein CitB  46.32 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0059  transcriptional regulatory protein CitB  46.32 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0057  transcriptional regulator CitB  46.32 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743375  normal  0.317361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0057  transcriptional regulator CitB  46.32 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.651756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  42.22 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  40.17 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3379  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.41 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.440522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.25 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.92 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  45.09 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  44.64 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  39.74 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  39.74 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  41.05 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  43.05 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.3 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  40.35 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  39.47 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  39.47 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  39.47 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  41.15 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.84 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  39.47 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  39.47 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  38.77 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.39 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  37.95 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  37.95 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  37.95 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.95 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  36.77 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  35.04 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.21 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.39 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.12 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.77 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.77 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.77 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  33.78 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  38.67 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.64 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  34.06 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  32.89 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  34.96 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  32.9 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  33.78 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  32.44 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32.03 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.04 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  32.89 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  32.89 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  31.56 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  35.71 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.6 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.78 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.6 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  34.08 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.17 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  33.48 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.65 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  30.63 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  31.86 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  33.33 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0471  response regulator  37.04 
 
 		 159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  31.08 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  29.73 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  30.18 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  30.63 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  36.44 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  30.63 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  30.63 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  30.63 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  30.49 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.49 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.19 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  31.14 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>