More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0284 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  70.56 
 
 
428 aa  641    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  82.33 
 
 
432 aa  739    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  82.33 
 
 
432 aa  744    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  100 
 
 
444 aa  919    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  63.26 
 
 
431 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  63.02 
 
 
436 aa  558  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  60.24 
 
 
427 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  60.24 
 
 
427 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  60.24 
 
 
427 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  60.47 
 
 
427 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  60.24 
 
 
427 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  60.24 
 
 
427 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  60.24 
 
 
427 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  60 
 
 
427 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  60 
 
 
427 aa  543  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  60.93 
 
 
431 aa  542  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  62.79 
 
 
436 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  59.81 
 
 
428 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  59.76 
 
 
427 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  60 
 
 
427 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  60 
 
 
427 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  59.76 
 
 
427 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  59.76 
 
 
427 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  62.33 
 
 
432 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  58.37 
 
 
431 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  62.56 
 
 
432 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  62.56 
 
 
432 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  58.93 
 
 
432 aa  508  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  52.91 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  51.29 
 
 
427 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  49.65 
 
 
427 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  50.82 
 
 
425 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  52.93 
 
 
427 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  51.06 
 
 
430 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  50.83 
 
 
424 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  50.59 
 
 
430 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  50.59 
 
 
430 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  50.59 
 
 
430 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  48.71 
 
 
425 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  50.83 
 
 
430 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  48.95 
 
 
425 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  50.59 
 
 
430 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  50.59 
 
 
430 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  50.59 
 
 
430 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  50.35 
 
 
430 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  51.3 
 
 
425 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  47.31 
 
 
425 aa  352  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  42.65 
 
 
492 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  37.7 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
482 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  41.11 
 
 
479 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  42.14 
 
 
616 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04810  leucyl aminopeptidase  43.21 
 
 
512 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.388112 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  38.37 
 
 
506 aa  216  5e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  36.36 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  38.94 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  41.41 
 
 
497 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
496 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  38.44 
 
 
483 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 
497 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  38.44 
 
 
483 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  40.87 
 
 
524 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  39.24 
 
 
490 aa  209  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  40.23 
 
 
497 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
503 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  41.8 
 
 
503 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  37.47 
 
 
491 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 
502 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 
508 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 
508 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  40.81 
 
 
505 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  39.38 
 
 
513 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.43 
 
 
487 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  39.94 
 
 
497 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  41.75 
 
 
455 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  40.68 
 
 
496 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  36.49 
 
 
454 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  40.87 
 
 
503 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  41.07 
 
 
485 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  38.55 
 
 
458 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  40.64 
 
 
495 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  40.94 
 
 
495 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 
503 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 
503 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
503 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  39.5 
 
 
454 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  38.25 
 
 
458 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 
503 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 
502 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  41.85 
 
 
512 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>