More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0256 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  100 
 
 
500 aa  1024    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  74.09 
 
 
501 aa  748    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  72.87 
 
 
501 aa  739    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  66.67 
 
 
501 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  53 
 
 
516 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  52.54 
 
 
511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  52.43 
 
 
511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  52.3 
 
 
519 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  52.1 
 
 
519 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  52.3 
 
 
519 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  52.64 
 
 
509 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  51.61 
 
 
513 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  51.02 
 
 
526 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  51.02 
 
 
526 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  51.02 
 
 
526 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  51.02 
 
 
526 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  51.82 
 
 
509 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  51.02 
 
 
513 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  50.81 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  50.61 
 
 
513 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  47.19 
 
 
509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  46.25 
 
 
520 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  41.94 
 
 
516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  43.7 
 
 
506 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  44.4 
 
 
508 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  45.17 
 
 
526 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  42.57 
 
 
501 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  44.97 
 
 
500 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  43.38 
 
 
501 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.85 
 
 
498 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  43.53 
 
 
500 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.85 
 
 
498 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.85 
 
 
498 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  42.97 
 
 
508 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.25 
 
 
498 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  44.08 
 
 
499 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.05 
 
 
498 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 
500 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  42.12 
 
 
500 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.65 
 
 
498 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  41.72 
 
 
500 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.84 
 
 
498 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  42.18 
 
 
500 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  42.36 
 
 
508 aa  363  4e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  41.85 
 
 
506 aa  359  7e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  42.71 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  41.94 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.04 
 
 
497 aa  356  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.18 
 
 
494 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  41.18 
 
 
494 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.18 
 
 
494 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.18 
 
 
494 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.18 
 
 
494 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  41.58 
 
 
497 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  40.97 
 
 
494 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.97 
 
 
494 aa  353  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.97 
 
 
494 aa  353  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  40.97 
 
 
494 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  41.87 
 
 
505 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  40.32 
 
 
505 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.4 
 
 
500 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.19 
 
 
497 aa  346  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  39.84 
 
 
518 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  42.8 
 
 
501 aa  343  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40 
 
 
495 aa  343  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  44.02 
 
 
520 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.66 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.45 
 
 
493 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  41.48 
 
 
499 aa  342  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.45 
 
 
493 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.45 
 
 
493 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.45 
 
 
493 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  42.6 
 
 
499 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  43.96 
 
 
520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  43.96 
 
 
520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  43.96 
 
 
520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  40.36 
 
 
512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  40.4 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  40.45 
 
 
499 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  40.32 
 
 
518 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  40.61 
 
 
508 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  40.12 
 
 
518 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  42.32 
 
 
517 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  39.72 
 
 
518 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  40.16 
 
 
507 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 
509 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  38.77 
 
 
520 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  38.13 
 
 
503 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  39.18 
 
 
506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  39.1 
 
 
491 aa  319  7.999999999999999e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  38.29 
 
 
502 aa  317  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  36.94 
 
 
510 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  38.37 
 
 
499 aa  312  9e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>