83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0141 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  84.91 
 
 
802 aa  1457    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  83.6 
 
 
762 aa  1360    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  51.82 
 
 
829 aa  880    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  85.16 
 
 
802 aa  1459    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  100 
 
 
801 aa  1679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  59.03 
 
 
797 aa  1018    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  42.77 
 
 
790 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  38.24 
 
 
784 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  37.13 
 
 
796 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  36.89 
 
 
824 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  35.91 
 
 
797 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  37.79 
 
 
809 aa  528  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  36.09 
 
 
823 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  37.18 
 
 
797 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  35.71 
 
 
813 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  35.71 
 
 
813 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  36.52 
 
 
785 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  37.35 
 
 
794 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  35.29 
 
 
784 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  34.01 
 
 
811 aa  497  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  35.27 
 
 
811 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  34.59 
 
 
822 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  34.92 
 
 
815 aa  482  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  33.29 
 
 
811 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  33.77 
 
 
811 aa  479  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  33.22 
 
 
819 aa  475  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  33.14 
 
 
822 aa  465  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  33.1 
 
 
831 aa  459  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  32.3 
 
 
815 aa  446  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  32.42 
 
 
811 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  31.55 
 
 
827 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  30.65 
 
 
786 aa  415  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  30.32 
 
 
849 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  28.78 
 
 
2748 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  29.02 
 
 
2922 aa  352  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  28.09 
 
 
2887 aa  340  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  27.48 
 
 
2786 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  29.38 
 
 
2901 aa  326  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  27.62 
 
 
1303 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  28.57 
 
 
2845 aa  320  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  28.59 
 
 
2929 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  29.89 
 
 
2831 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  27.54 
 
 
2880 aa  317  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  28.76 
 
 
2864 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  27.82 
 
 
2864 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  28.4 
 
 
2747 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  29.77 
 
 
2868 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  28.61 
 
 
2748 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  28.25 
 
 
3021 aa  313  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  28.67 
 
 
2758 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  28.94 
 
 
2875 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  28.43 
 
 
2932 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  27.42 
 
 
2823 aa  308  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  29.11 
 
 
2874 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  28.02 
 
 
2860 aa  295  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  26.57 
 
 
2888 aa  294  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.46 
 
 
2868 aa  293  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  28.42 
 
 
2842 aa  293  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  27.76 
 
 
2905 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  28.83 
 
 
2881 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  28.38 
 
 
2761 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.06 
 
 
2859 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.32 
 
 
2864 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.19 
 
 
2732 aa  285  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  27.96 
 
 
2916 aa  283  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  27.43 
 
 
2769 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  26.81 
 
 
2716 aa  272  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  26.57 
 
 
2839 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  26.99 
 
 
2833 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  26.26 
 
 
2884 aa  255  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  26.11 
 
 
2870 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  26.01 
 
 
2839 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  28.39 
 
 
624 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.8 
 
 
2793 aa  228  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  23.94 
 
 
788 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  24.49 
 
 
2730 aa  215  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  24.82 
 
 
2731 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  25.42 
 
 
801 aa  204  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  26.95 
 
 
2779 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  23.77 
 
 
802 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  23.99 
 
 
984 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  31.58 
 
 
2453 aa  95.9  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  29.46 
 
 
801 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>