More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0140 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  100 
 
 		 470 aa  965    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  89.57 
 
 		 470 aa  859    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  83.83 
 
 		 470 aa  814    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  89.57 
 
 		 470 aa  856    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  54.68 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  51.06 
 
 		 473 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  42.22 
 
 		 733 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  40.34 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  38.38 
 
 		 471 aa  335  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.41 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  38.97 
 
 		 486 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  37.42 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  35.56 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  36.89 
 
 		 467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  36.5 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  37.66 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.58 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  36.72 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.8 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  35.96 
 
 		 473 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.31 
 
 		 469 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  37.31 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  37.58 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.86 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.33 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.33 
 
 		 474 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.1 
 
 		 472 aa  289  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.84 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.63 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.81 
 
 		 472 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  34.61 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.12 
 
 		 469 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.97 
 
 		 469 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  35.81 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.54 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  36.54 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  35.84 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.47 
 
 		 472 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  36.3 
 
 		 414 aa  259  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  35.57 
 
 		 409 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  34.42 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.12 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  32.98 
 
 		 458 aa  249  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  33.91 
 
 		 460 aa  246  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  32.9 
 
 		 460 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  32.41 
 
 		 457 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  33.55 
 
 		 460 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  32.9 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  31.9 
 
 		 501 aa  236  7e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.69 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  32.84 
 
 		 460 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  30.9 
 
 		 472 aa  232  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  33.19 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  33.55 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.46 
 
 		 463 aa  225  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  32.84 
 
 		 482 aa  223  6e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.79 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  31.67 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  30 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  32.15 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  31.13 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  30.66 
 
 		 484 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.59 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  30.31 
 
 		 484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  29.34 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  29.88 
 
 		 490 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  30.75 
 
 		 486 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  30.56 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  29.87 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.72 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  28.51 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  31.93 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.33 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  28.79 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.43 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.96 
 
 		 480 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  28.3 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  30.13 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.66 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  28.66 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.28 
 
 		 518 aa  180  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  30.57 
 
 		 548 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  29.38 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  28.45 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  29.61 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  29.39 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  30.2 
 
 		 545 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  28.75 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  29.23 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.84 
 
 		 576 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  26.82 
 
 		 559 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  28.66 
 
 		 547 aa  163  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  28.23 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  29.3 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  27.34 
 
 		 568 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.4 
 
 		 574 aa  161  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  28.83 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  27.88 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  28.27 
 
 		 548 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>