More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1127 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  100 
 
 
443 aa  906    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  51.82 
 
 
440 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.02 
 
 
443 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.69 
 
 
446 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
443 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  39.13 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  37.19 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  36.97 
 
 
447 aa  274  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  36.54 
 
 
445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  35.41 
 
 
447 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  36.34 
 
 
446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  35.19 
 
 
447 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  37.44 
 
 
464 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  35.76 
 
 
445 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  37.09 
 
 
446 aa  246  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  36.6 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  36.34 
 
 
442 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  36.95 
 
 
438 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  35.97 
 
 
445 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  33.47 
 
 
460 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  35.07 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  34.56 
 
 
489 aa  216  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  35.8 
 
 
438 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  35.8 
 
 
438 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  36.17 
 
 
434 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  36.08 
 
 
434 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.52 
 
 
424 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.43 
 
 
419 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  26.36 
 
 
419 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.82 
 
 
430 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.78 
 
 
419 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  23.74 
 
 
419 aa  94  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.3 
 
 
494 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  26.86 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.71 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  31.31 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.23 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.34 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.46 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.72 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  22.78 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.4 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.26 
 
 
687 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.33 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  27.73 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.92 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.92 
 
 
444 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.8 
 
 
448 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.14 
 
 
447 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7472  ferredoxin  32.42 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.554725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  28.93 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.77 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.49 
 
 
456 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.36 
 
 
337 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  27.92 
 
 
627 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.26 
 
 
676 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.08 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4909  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.43 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.15 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  29.19 
 
 
678 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  28.57 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  25.79 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.87 
 
 
344 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.41 
 
 
690 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  25.55 
 
 
422 aa  61.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.96 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.73 
 
 
678 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.68 
 
 
340 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.57 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.95 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.55 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.36 
 
 
342 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.19 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.12 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  29.66 
 
 
328 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.89 
 
 
687 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.7 
 
 
341 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.86 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.57 
 
 
390 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.15 
 
 
686 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  26.77 
 
 
393 aa  57  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.92 
 
 
336 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.87 
 
 
342 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.04 
 
 
328 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  28.06 
 
 
397 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0230  globin  27.22 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.35 
 
 
688 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.51 
 
 
232 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0224  globin  27.22 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  26.11 
 
 
338 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.7 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  26.4 
 
 
336 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.85 
 
 
752 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  26.44 
 
 
674 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.88 
 
 
682 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  26.29 
 
 
597 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.5 
 
 
340 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.5 
 
 
340 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  24.68 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>