65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1028 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1312    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  38.98 
 
 		 650 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  31.62 
 
 		 368 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  31.1 
 
 		 617 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  32.12 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  29.39 
 
 		 378 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  30.28 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  27.24 
 
 		 370 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  32.28 
 
 		 458 aa  107  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  32.44 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  35.57 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  31.2 
 
 		 367 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  30.14 
 
 		 391 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  28.85 
 
 		 470 aa  93.2  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  30.56 
 
 		 354 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  32.99 
 
 		 399 aa  92  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  30.97 
 
 		 349 aa  89.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  26.02 
 
 		 397 aa  87.8  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  32.71 
 
 		 386 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  29.12 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  27.86 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  32.85 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  33.51 
 
 		 369 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  34.19 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  31.1 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  27.59 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  32.97 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  27.15 
 
 		 394 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  29.67 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  29.07 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  32.1 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  27.24 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  30.32 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  27.24 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  26.51 
 
 		 375 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  26.51 
 
 		 375 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  28.51 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  28.23 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  32.35 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  28.03 
 
 		 374 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  25.39 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  24.32 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  28.76 
 
 		 402 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  25.98 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  27.2 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  26.84 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  27.84 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  24.74 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  30.23 
 
 		 589 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  25.94 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  27.35 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  27.18 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  30.89 
 
 		 159 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  26.6 
 
 		 377 aa  54.3  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  26.8 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  32.18 
 
 		 130 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  28.32 
 
 		 392 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  25.58 
 
 		 168 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  27.1 
 
 		 388 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  25.37 
 
 		 546 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>