130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1023 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.58 
 
 
447 aa  771    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  74.88 
 
 
441 aa  665    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
442 aa  889    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  89.57 
 
 
443 aa  810    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  89.34 
 
 
443 aa  811    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.56 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.56 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.34 
 
 
447 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.11 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  49.77 
 
 
441 aa  438  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.87 
 
 
447 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.42 
 
 
447 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.77 
 
 
447 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.77 
 
 
447 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.52 
 
 
447 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.77 
 
 
447 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.77 
 
 
447 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.42 
 
 
447 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.42 
 
 
447 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.11 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.71 
 
 
438 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.58 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3540  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.5 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000247021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  48.07 
 
 
433 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.03 
 
 
442 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3576  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  46.42 
 
 
446 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3863  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.37 
 
 
446 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39327  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2921  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.39 
 
 
443 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.49 
 
 
443 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000133068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.27 
 
 
441 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0561  C4-dicarboxylate transporter, anaerobic  46.52 
 
 
442 aa  382  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0772  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.83 
 
 
474 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0697  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.83 
 
 
474 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1406  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.37 
 
 
446 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1813  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.37 
 
 
446 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.56 
 
 
453 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.91 
 
 
453 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.35 
 
 
453 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  45.33 
 
 
441 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.8 
 
 
453 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03994  C4-dicarboxylate antiporter  46.53 
 
 
446 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3869  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  46.53 
 
 
446 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5637  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.53 
 
 
446 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.363668  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03955  hypothetical protein  46.53 
 
 
446 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.905652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.53 
 
 
446 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3904  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.53 
 
 
446 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4589  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.53 
 
 
446 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4696  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.04 
 
 
446 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.04 
 
 
446 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873915  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.04 
 
 
446 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.04 
 
 
446 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4565  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.04 
 
 
446 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  43.37 
 
 
443 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.2 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.2 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.95 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.95 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.19 
 
 
437 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.95 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.18 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.2 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.95 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.73 
 
 
437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.64 
 
 
437 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.39 
 
 
437 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  42.01 
 
 
441 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.58 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  41.5 
 
 
439 aa  333  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.32 
 
 
439 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.41 
 
 
439 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.54 
 
 
439 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.54 
 
 
439 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.54 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  37.64 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.75 
 
 
435 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  35.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.6 
 
 
433 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1121  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.43 
 
 
438 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.02 
 
 
433 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0683  anaerobic c4-dicarboxylate transporter DcuB  35.63 
 
 
444 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3679  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.84 
 
 
433 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.84 
 
 
433 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3826  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.84 
 
 
433 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.83 
 
 
433 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002213  C4-dicarboxylate transporter anaerobic  37.31 
 
 
435 aa  269  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0405  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.43 
 
 
433 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219267  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00155  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.31 
 
 
435 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1910  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  36.02 
 
 
433 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0126461  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.62 
 
 
433 aa  266  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0681  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  34.43 
 
 
415 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4686  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
433 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4743  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
433 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.722845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4595  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
433 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4603  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
433 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
433 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  34.78 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  34.78 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  34.78 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  36.63 
 
 
433 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  36.63 
 
 
433 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>